Eve Duperray a suivi des études en Lettres supérieures au lycée Edouard-Herriot puis à la faculté des lettres de Lyon-III (licences d'histoire et de philosophie – maîtrise d'histoire), et à Paris I-Sorbonne (DEA et doctorat en histoire moderne). Elle a été boursière de l'Ecole française de Rome en 1989 et a obtenu en 2000 sa qualification aux fonctions de maître de conférences en histoire moderne.
Spécialiste d'histoire littéraire, notamment de Pétrarque et du pétrarquisme en France, elle a également travaillé sur l'espace sacré en Provence et sur la production artistique des paroisses rurales. Elle a dirigé de nombreuses publications et est l'auteur d'ouvrages comme L'or des mots (Publications de la Sorbonne, 1997) ou encore Tourne-toi vers Elle (Actes Sud, 2013). Elle est conservateur en chef, actuellement responsable du Service de la conservation départementale des musées et du patrimoine de Vaucluse.