Dans une mégalopole saturée par la pollution, deux jeunes filles de milieux opposés se rencontrent lorsqu'un programme écologique qui leur est cher menace d'être formaté. Pour protéger ces oiseaux virtuels qui pourraient sauver la biodiversité, les adolescentes s'infiltrent dans le milieu du terrorisme écologiste et cherchent une manière de contrecarrer les plans de Texxon, l'entreprise propriétaire de ces animaux. L'Ombre des oiseaux est une dystopie environnementale qui aborde une possible symbiose entre numérique et nature, mais aussi le deuil et le handicap, le tout sur un ton optimiste où la technologie renferme sa part de poésie.