Chercheur associé au CESDIP (CNRS), a publié de nombreux travaux sur la lutte armée communiste, parmi lesquels Liquider les traîtres (Robert Laffont, 2007), un livre coécrit avec Jean-Marc Berlière.
Membre du comité de rédaction de la revue universitaire Communisme, Sylvain Boulouque est l'auteur de différents ouvrages d'histoire politique. Il a notamment codirigé Traîtres et Trahisons (Seli Arslan, 2007).